Francisco Arredondo inicia su participación en el Rally Dakar en el año 2004 cuando tenia 26 años, siendo el primer centroamericano que ingresa a esta competencia de nivel internacional.
En el 2004 hace su primera aparición, pero no le fue muy bien, ya que tuvo que abandonar en la octava etapa y lo mismo sucede en el año 2005. Luego de dos intentos, en el año 2006, logra finalizar su primer Dakar cubriendo las rutas por Portugal, España, Marruecos, Mauritania, Malí, Guinea y Senegal, terminando la dura competencia en el puesto 58 de 231 pilotos de motocicletas.
El último Dakar realizado en África, fue en el del año 2007, en el que Francisco Arredondo terminó la carrera en la posición 78 de 250 pilotos inscritos. En el año 2008, Se suspendió el Rally por amenazas terroristas y se trasladó al continente americano. Francisco se hace presente en el Dakar 2009, pero lamentablemente en la etapa 8 sufre un accidente debido a que su GPS le falló y lo desvió un kilómetro de la ruta establecida en donde sufrió una grave caída y lesiones en el hombro derecho y la espalda, lo que le impidió continuar en la competencia mientras se situaba en la posición 31 de la general.
En el año 2010, mientras competía en la etapa 8, y recorría el kilómetro 331 de la especial, sorpresivamente su motocicleta empezó a sacar llamas de la zona del motor y por esta razón tuvo que abandonar la competencia. En el año 2011, el éxito acompaña a Francisco y logra terminar todas las etapas del Dakar, quedando en la posición 37 de 186 pilotos inscritos en la categoría de motos.
En la edición del año 2012, Arredondo sufrió una caída en la etapa 5, de la que resultó lesionado de una costilla, y a pesar de eso continuo pero en la etapa 9 tuvo que abandonar a causa de la explosión de su llanta delantera, lastimosamente no encontraron una llanta que pudiera reemplazar la dañada y tuvo que salir de la competencia cuando estaba en la posición 45. En el 2013, nuevamente termina exitosamente todas las etapas del Dakar, y tuvo una excelente participación en la última etapa que lo hizo subir tres posiciones, finalizando el Dakar en el puesto 37 con un tiempo de 51 horas, 20 minutos y 8 segundos.
El año pasado Francisco sufrió una lesión en el brazo derecho pero esto no fue impedimento para terminar el Dakar en todas sus etapas, quedando en la posición 44 de la tabla general de 78 pilotos en la misma categoría. Actualmente, Francisco Arredondo esta compitiendo en el Dakar 2015 que se está llevando a cabo en los territorios de Argentina, Bolivia y Chile.